kurgus: (Flammable)
Eclund et al. Cluster failure: Why fMRI inferences for spatial extent have inflated false-positive rates. PNAS, May 2016
Functional MRI (fMRI) is 25 years old, yet surprisingly its most common statistical methods have not been validated using real data. Here, we used resting-state fMRI data from 499 healthy controls to conduct 3 million task group analyses. Using this null data with different experimental designs, we estimate the incidence of significant results. In theory, we should find 5% false positives (for a significance threshold of 5%), but instead we found that the most common software packages for fMRI analysis (SPM, FSL, AFNI) can result in false-positive rates of up to 70%. These results question the validity of some 40,000 fMRI studies and may have a large impact on the interpretation of neuroimaging results.
kurgus: (Flammable)
Самое IMHO красивое в них - кокцинеллин, содержащийся в гемолимфе:

И весь из себя красивый трициклический скелет, и мостиковый азот, и N-оксид, не слишком часто встречающийся в природе.
Считается, что кокцинеллин, наряду с моноциклическим родичем адалином, ответственен за невкусность гемолимфы божьих коровок,

Вот его полный синтез Стивенсом (1979) с ключевым замыканием по Робинсону-Шепфу (выделено желтым. Эта реакция - первый, наверное, биомиметический синтез - 1917 г. - тропановые алкалоиды, включая кокаин):

Этот синтез Стивенса уже вошел если не в анналы, то в экзаменационные билеты курса "Стратегия оргсинтеза" химфака МГУ, кодовая фраза - "1,5-дикарбонильные ретроны" :)

И мысли по его биосинтезу - P. Laurent et al. Insect Biochemistry and Molecular Biology 32 (2002) 1017–1023 (полный текст).
Включая зверское ядерное расчленение божьих коровок эксперименты с синтезом in vitro в тканях кокцинеллид.

P.S. В околонаучной ру-литературе кокцинеллин и адалин (адален) обзывают алкалоидами.
Но какие же это алкалоиды из животных?
Так можно договориться до того, что и тетродотоксин фугу, и сакситоксин динофлагеллят - алкалоиды.
kurgus: (Flammable)
Федерико Инфашелли (Federico Infascelli), профессор от ветеринарии в университете Federico II в Неаполе напубликовал статей[1-3] об ужасах ГМО: ежели козлов коз кормить ГМО-соей, то в их молозиве обнаруживаются фрагменты трансгенной ДНК и оно оказывается диетическим обезжиренным, а козлята рождаются несчастными мельче и слегка обездоленными по IgG.

Столь выдающийся результат отечественной науки не остался незамеченным и отцы-сенаторы пригласили Инфашелли на слушания по ГМО.
Read more... )


фото из статьи о том же в Strade "OGM, TRA SCIENZA E ATTIVISMO: LA BRUTTA STORIA DEI DATI MANIPOLATI A NAPOLI" - "ГМО между наукой и активизмом: скверная история о подтасовке данных в Неаполе"
kurgus: (Фотоложество)
Хохлатки (укр. ряст) Corydalis spp. массово цветут.
Красота неописуемая, аромат, ботинки, желтые от пыльцы и все такое прочее:
DSCF9442

+4 - и не только хохлатки... )
kurgus: (Flammable)
В контексте всяческих обсуждений о необходимости дли-и-ительных испытаний потенциальных последствий употребления в пищу всяческих (ГМ)организмов вспомнилось.

Рассказ сотрудника керченского АзЧерНИРО (ныне ЮгНИРО) о буднях Продовольственной программы КПСС.
В порядке расширения продовольственной базы шастали они по океанам на предмет выявления новых промысловых рыб.
Далее цитирую по памяти:
Ну забрасываем трал, если улов по одному виду достаточен - на камбуз. Если пронесло менее четверти народа - вписываем в кандидаты в промысловые виды.
kurgus: (Flammable)
Интересная статья с красноречивым названием:

И там замечательная картинка по систем определения таксонам.
С особым положением рыб, у которых почти половина видов на заморачиваются с постоянным полом и практикуют последовательный гермафродитизм со сменой пола по возрасту или иным событиям.
И не менее удивительна распространненность псевдоарренотокии - "убийства отцовского генома", paternal genome elimination у кокцид:


P.S. Об арренотокии - партеногенез, в результате которого появляются самцы звучит оксюморонисто: παρθένος ведь на єллинском - дева...
kurgus: (Фотоложество)
Объявлены итоги 2015 г. конкурса  Nikon Small World, фото-победители - здесь.

Первое месо - глаз пчелы банальной медоносной Apis mellifera в пыльце одуванчика:


Но мне больше понравился портрет конхострака - листоногого раковиного рачка Cyzicus mexicanus (10 место):

Кстати, они живут и в пресных лужах мелких водоемах спедней полосы Европы - включая Украину и РФ, см., например, портретную галерею этих созданий в различных ракурсах у [livejournal.com profile] pogonin_sv.
kurgus: (Фотоложество)
Компания со скромным названием Light объявила о приеме предзаказов на фотокамеру Light 16 - этакий компактный портсигар, у которого на "снимающей" стороне 16 камерных модулей:

Что интересно, эти камерамодули трех типов - точнее, с различными фокусными расстояниями - 35 мм, 70 мм и 150 мм (в 35-мм пленочном эквиваленте, естественно).

Обещают множество плюшек:
1. 35-150 мм почти оптический трансфокатор - одновременно снимаем на всех фокусных расстояниях - и промежуточные интерполируем.
Что правильно, максимальное разрешение получившегося изображение - по центру поля зрения, что весьма филиологично - типа macula lutea, желтое пятно с максимальной остротой зрения в центре нашей сетчатки. И без слепого пятна :)
2. Эмуляцию трех светлых (f 1.2) фикс-объективов - снимаем на одном из фокусных расстояний и усредняем сигнал - типа пиксел биннинг в Hasselblad или Fuji X10 - но без потери разрешения матрицы
3. Фокусировка и размытие фона post factum. Типа как в lightfield-камерах вроде Litro, сенсоры которых которые чувствуют не только скалярную компоненту света (интенсивность), но и векторную (угол падения).
Здесь, насколько я понимаю, все скалярно - съемка насколькими модулями с одинаковым фокусным расстоянием с различной фокусировкой - этакий фокус-брэкетинг с последующими математическими фокусами.
Примерно тот же принцип, что и в focus stacking при макросъемке.

Там еще за счет параллакса множества модулей, в принципе, можно считать карті глубин и делать 3D, но об этом они молчат.

И, что не менее интересно, эта камера несколько сот миллионов лет работает в природе - именно такой набор глаз обеспечивает зрение пауков-охотников (кликабельно):

У пауков тоже множество глаз (у большинства - 8, у накоторых - 12) различного размера и с различным фокусным расстоянием.
Если посмотреть картинку сверху в полном размере (настоятельно рекомендую), то можно увидеть, что поверхность глаз у них не разделена на фасетки, как у насекомых - у пауков настоящие камерные глаза с хрусталиком, стекловидным телом и сетчаткой, особенно длиннофокусные главные глаза (Anterior Median Eyes). А также с фокусировкой главных глаз - у них подвижная сетчатка, которую шевелят аж 6 мышц (ага, 5-осевая стабилизация сенсора в Olympus OM-D EM-5 и далее).

А у особо продвинутых пауков-скакунчиков Salticidae в главных глазах  еще и двухлинзовый объектив - кроме хрусталика есть еще и надсетчаточная линза, образованная слоем специализированных прозрачных клеток:
Схема глаза сальтицид )
kurgus: (Flammable)
Vysotskii V.I., Kornilova A.A., Transmutation of stable isotopes and deactivation of radioactive waste in growing biological systems. «Annals of Nuclear Energy», 2013, 62, 626—633

Вот как бывает: если взять культуру банальной Bacillus subtilis или еще более банальной E. Coli и накапать туда тяжелой воды, то эти бактерии офигевают настолько, что в них запускаются термоядерные реакции (здесь и далее нотация оригинала):
Mn55 + d2 => Fe57
Но можно обойтись и без тяжелой воды: Bacillus subtilis от нефиг делать занимаются вот такой трансмутацией
Na23 + P31 => Fe54
Наверное, у них в организмах железа не хватает.

Причем это дело подтверждено масс-спектрами с фотографиями стрелки экрана осциллографа и Мессбауэр-спектрами.

Но если не заморачиваться чистыми бактериальными культурами, а взять лопату земли какое-нибудь естественное сообщество микроорганизмов, то получается целый microbial catalyst-transmutator, который термоядит еще охотнее, например вот так:
Ba140 + C12 => Sm152
Или даже эдак:
Cs137 + P1 => Ba138
Это получается, если полить сию биомассу святой первоконтурной реакторной водой, при этом она жрет вкусные радиоактивные изотопы со скоростью в 35 раз превышающей темп их естественного распада.

Сразу хочется взять для загрузки в microbial catalyst-transmutator лопату не почвы, а кой-чего другого: микробиосообщество, населяющее человеческий кишечник, офигенно разнообразно, покруче почвенного.
Или даже не заморачиваться с лопатой, а засунуть интактного человечка под Мессбауэр-спектрометр.

P.S. Сей труд - результат коллаборации Московского и Киевского университетов, реакторная вода слита из реактора киевского института ядерных исследований.
P.P.S. Пошел перечитывать Азимова, "Гусыню, которая несла золотые яйца". На предмет чего ливануть в выгребную яму microbial catalyst-transmutator, чтобы содержимое трансмутировалось в золото.
kurgus: (Flammable)
С середины прошлого века высказывались предположения, что билингвизм субъекта должен оказывать влияние на его когнитивные процессы, при этом диапазон предположений о механизмах и последствиях был чрезвычайно широк - от влияния на IQ (так сказать, прагматики) до разборок - что же первично - язык или мышление? (обзовем их лингвофилософами).
И над всем этим реял Ноам Хомски, поплевывая на всех с сияющих вершин.

Прагматики, синергисты, Хомский... )

Но недавно в дело вступила тяжелая артиллерия в лице медстатистиков проплаченных жадными страховыми компаниями и начала интересоваться а как там у билингвов в сравнении с монолингвами обстоят дела со старческим маразмом снижением умственных способностей при старении?

И, мало того, что билингвы, похоже, маразмируют позже сохраняют умственную бодрость дольше монолингвов (см. Bialystok et al. Bilingualism, Aging, and Cognitive Control: Evidence From the Simon Task. Psychology and Aging, Vol 19(2), Jun 2004, 290-303 - и почему при чтении вспоминается code-switching билингвов? :) )
Так оказывается, что и Альцгеймер к ним подкрадывается позже, чем к любителям единственного языка:
Fergus et al. Delaying the onset of Alzheimer disease: Bilingualism as a form of cognitive reserve. Neurology November 9, 2010 vol. 75 no. 19 1726-1729
Что чисто биохимически совсем уж загадочно.

P.S. В связи с последней публикацией почему-то вспоминается симферопольская пенсионерка с русскоязычной челюстью из прошлогодних новостей ATR.
kurgus: (Фотоложество)
В этом году на озере у Бабенковки (Херсонская область у крымской границы, между Каланчаком и крымским Армянском) увидел вот таких птичек:
P8111322 - Version 2
Раньше пеликанов - да и птиц в таких количествах - там не видел.
Говорят (и пишут), что после отключения Северо-Крымского канала ранее опресненный сбросами вод с крымских рисовых полей северный Сиваш начал опять быстро засаливаться, что и вызвало миграцию всяческой водозависимой орнитофауны на север, в слабосоленые озера Херсонской области и дальше.
Знакомые из Южноукраинска говорили, что видели в этом году пеликанов и в Побужье - в центре и севере Николаевской области.

P.S. Что за вид? - розовый пеликан Pelecanus onocrotalus?
+3 фото... )
kurgus: (Фотоложество)
Августовский Чокрак:
Salt lakes of Kerch peninsula, Crimea, Ukraine
В августе соленые озера Керченского полуострова розовы: вода испаряется до насыщения рапы и высадки соли - и в самой рапе интенсивно размножаются галобактерии, у которых фотосинтез осуществляет бактериородопсиновая система - откуда и розовая окраска.
А в этом году к тому же в первой половине лета аномально много дождило, поэтому степь еще зеленая, а не рыжая.
И еще в начале августа приазовская степь была испещрена розовами пятнами бессмертника Xeranthemum annuum (сейчас уже в основном отцвел), лиловатыми - кермеков Limonium spp и, у побережья, синими эхинопсов Echínops spp.
В общем, красота неописуемая.

P.S. Halobacteria вообще-то на самом деле - археи Haloarchaea
kurgus: (Фотоложество)
Позавчера, Южный Буг у Южноукраинска.
Вечером похолодало и на берегу - огромное количество стрекоз, и в процессе линьки, и выбравшихся из личинок.
Причем часть личинок преодолела 20-30 м полосу пляжа и выбралась для линьки на траву.
P5030598
+3 )
kurgus: (Фотоложество)
Одно из моих любимейших весенних зрелищ - массовое цветение хохлатки полой (укр. ряста порожнистого) Corydalis cava.

Киев, окрестности Феофании:
Hollowroot (Corydalis cava) bloom #1. Kiev, Ukraine. / Хохлатка полая Corydalis cava - цветение. Киев, Украина

+2 фото... )
kurgus: (Flammable)

На позапрошлых выходных были пролески двулистные.
А на этих, кажется, нашел сибирские Scilla siberica. Спасибо [livejournal.com profile] ondo_the_linde за напоминание о них :)

Спасибо

kurgus: (Flammable)
Я давно и с удовольствием пользуюсь Systema Naturae 2000 в качестве таксономического справочника - посмотреть иерархию вид-род-семейство-..., омонимию и пр.

Потомок этой системы, живущий параллельно с ней - Taxonomicon, который первоначально был несколько расширенной версией Systema Naturae. Верх иерархии которого выглядел, я бы сказал, несколько эпически многообещающе :) -
Natura
  Mundus Plinius
    Biota

И вот, забравшись в очередной раз в Таксономикон, с удивлением обнаружил, что там, наряду с биотой, появилась и ветвь химии с вот такими таксономическими порядком и подпорядками:
chemical substances
  chemical elements

  reactive intermediates
  chemical compounds

Насколько это дело соответствует IUPAC Gold Book - надо будет посмотреть, но то, что касается самого Таксономикона, то он сделал попытку превратиться в Единую Таксономию Всего, поскольку:

  1. Между Natura и Mundus Plinius появил(а/и)сь actualia - actual entities.

  2. А Natura стала гораздо разнообразнее - теперь там, на одном уровне с actualia находятся spiritual entities incertae sedis, mathematical entities и ficta - fictional entities :)

Правда, все вне actualia на уровне заглушек с микрообразцами иерархий.
Материалисты, однако :)  Стихийные. Ибо биологи.
kurgus: (Flammable)

Вчера, Феофания.

Некая пролеска Scilla spp (bifolia?).
Между прочим, пролески - из семейства спаржевых (Asparagaceae).

Гусиный лук Gagea lutea

kurgus: (Фотоложество)
Чадолюбивая болотная курочка Gallinula chloropus несется кормить потомство.
/Киев, Голосеевские озера/

Profile

kurgus: (Default)
kurgus

June 2017

S M T W T F S
    123
45678910
111213 14151617
18192021222324
252627282930 

Syndicate

RSS Atom

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Sep. 23rd, 2017 02:09 am
Powered by Dreamwidth Studios